Das Herzstück jedes Zytometers ist eine hochpräzise Durchflussküvette aus Quarzglas mit einem sehr feinen Kanal. Dieser garantiert die Stabilität des strömungstechnischen Systems und ermöglicht somit die präzise optische Analyse einzelner Zellen oder Partikel.
Der typische Durchflusskanal hat eine quadratische oder rechteckige Form mit Abmessungen von nur wenigen hundertstel Millimetern und verfügt über hochwertig polierte Oberflächen.